传说归传说，寿山石及田黄石在地质学上总有必然的成因。本来在地质的中生代（距今约2.3亿年到6700万年），在今天福建东部的范畴内，曾呈现过一次地质大变换，火山大发作，大量岩浆打破地表形成了冲天的烈焰，陪伴火山喷发带来大量的酸性气体、液体，瓜代解析了周围岩层中的长石类矿物，将其原先含有的较量活泼的钾、钙、镁和铁等元素分化，而保存下较为不变的铝、硅等元素，这些含铝、硅元素的溶液，其后从头冷却结晶成矿，这就是漫衍在寿山乡群山中的寿山石诸矿。
至于田黄石，通行的说法是在数百万年前的第三纪末期，由于风雨的剥蚀，盛产寿山佳石的“高山”矿脉中的部门矿石从矿床中疏散出来散落在溪旁的基本层上，今后慢慢为砂土层所包围。这些矿石隐藏于砂土中，天长日久，外貌所含的三氧化二铁受周围泥土、水分及湿度等因素的影响，徐徐酸化，使石块改变了原有的脸孔，形成了独具特色的田黄石。
按照现有的地质学成就，我们知道寿山石的形成是低温热液矿，寿山石都是“填充”在白锈石的偏差之中的。可是我们今朝所见到的田黄石，或其他“掘性独石”却都是单一的“寿山石”，而没有寿山石和花岗石“粘”在一起的石头。那么，是不是当初有少少的一部门低温热液矿未能填充到白锈石的岩缝中，而是留在地表了呢？只有这样它们才大概在地壳的变换和风雨的剥蚀下从高山上滚落到山下去。只有这样我们才大概发明没有和白锈石粘在一起的寿山掘性独石和田黄石。
我们不知道高山的原始地貌，但从今天的地貌看，高山是一座典范的锥型山峰，假如地壳变迁或风雨剥蚀，高山地表的寿山石原生矿应该往附近滚落下去。可是我们至今只在高厦门南面的坑头溪及其下游寿山溪的流域发明白田黄。而同在高山之下，仅隔坑头溪数步之遥的大段溪，却至今没有发明过田黄。
从坑头溪的源头到寿山溪的下游结门潭，全长八公里，生产田黄石的地皮仅为一平方公里。并且即即是“生产”田黄石的处所，也被分之为：上坂、中坂、下坂和碓下坂。四坂所产的田黄也有较明明的区别，上坂田的田黄质灵色淡；中坂田的田黄质嫩色浓；下坂田的田黄质凝腻，而作桐油色；碓下坂的田黄，质粗硬，色黝暗。为什么同为从高山上滚入田中的母石，会在各坂的水田中有这么大的变革呢？至今我们还没有获得令人信服的谜底。
前面已经说过了，田黄石的形成是数百万年的事，而“田”只是人类勾当的产品，应该说人类勾当产品的“田”对田黄石的外部特征及光华变革所起的浸染不会太大（但因系农夫烧稻根做肥料，而造成的“煨红田”除外），影响它们的应该是日夜浸润着它的溪水———即和坑头溪的水质有极大干系。
据寿山石农先容坑头溪的水长短常“利”（音）的，起初人们开采的白色寿山石被废弃在溪水中，现在表皮已变黄。人类开采寿山石的汗青不外一千数百年，被人类废弃地头溪中的寿山石汗青最长也不会高出这个时间，短的大概只有几十年，在这么短的时间里城市起变革，那么被浸润数百万年的田黄石其变革是完全可以想见的。
我们已经无法知道寿山溪在数百万年前的原始状貌，可是就今朝人们对上、中、下三坂的分别，却是与寿山村的三条溪流有着密不行分的干系。即上坂是坑头溪流经的区域；中坂是坑头溪和大段溪会集后流经的区域；下坂则是坑头溪和大段溪会集后又与大洋溪会集后流经的区域。假如用溪水来表明田石为什么会有那么大的质地和光华的不同，好象较量轻易领略一些。即上坂田石浸润的是100%的坑头溪水，这种水质中某种元素较量浓，所以被浸润的田石较量通透，颜色较淡；中坂田石浸润的是50%的坑头溪水，此时水质的某种元素较量中和，所以被浸润的田石较量潮湿。颜色也较量丰满；下坂田石浸润的是25%的坑头溪水，此时水质中的某种元素已经较淡，对田石的浸染淘汰，所以被浸润的田石较量凝腻，颜色也较量黝暗，虽然各溪的水流量不尽沟通，这里不外是个比喻，或者这样才气表明田黄石的成因及上、中、下坂田黄石的区别。
不外，这里又有一个问题，因为田黄石不仅是有通体一色的，外部色黄而内部色淡的，不仅有“金包银”的，并且尚有“银包金”的，尚有乌鸦皮的，这或者是除了溪水浸润的浸染之外，尚有一个重要因素，就是每一块田黄所处的“小情形”的影响。据寿山石农先容，挖于白砂砾处的田黄多为挂黄皮，挖于黑泥处的田黄多为乌鸦皮，这种说法是否科学，今朝无法求证。在田黄石已近绝产，而田黄石产地原始地貌已遭严重粉碎的情形下，此后大概也无法求证了，只能将此说法做一记实以备参考。
